Универсальные гены аутизма

Новое масштабное генетическое исследование показало: ключевые гены, связанные с развитием аутизма, одинаковы у людей вне зависимости от их происхождения. Ученые проанализировали ДНК более чем 15 тысяч жителей стран Латинской Америки — региона, где население отличается значительной генетической смесью коренных народов, африканских и европейских корней. Работа опубликована в журнале Nature Medicine и подчеркивает необходимость более разнообразных медицинских баз данных.

За последние годы исследователи выявили десятки редких генетических изменений, которые повышают вероятность развития аутизма. Эти изменения чаще всего встречаются в генах, которые почти не менялись в ходе эволюции — так называемых высоко консервативных генах. Они отвечают за базовые процессы в клетке, и любые ошибки в них обычно приводят к серьезным сбоям развития.

Однако большинство генетических баз данных составлены преимущественно на основе ДНК людей европейского происхождения. Это создает проблемы: людям других корней при генетическом тестировании нередко дают неопределенные результаты, потому что их варианты генов просто отсутствуют в справочниках.

Чтобы исправить этот дисбаланс, была создана международная группа Genomics of Autism in Latin American Ancestries. Команда под руководством Марины Нативидад Авила и при участии Джозефа Д. Буксбаума исследовала, отличаются ли генетические факторы риска аутизма у людей разных исторических корней.

В работе участвовали около 4,7 тысячи людей с диагнозом аутизм, их родители и здоровые братья и сестры. Сравнивая ДНК детей и их родителей, ученые выявляли спонтанные мутации — изменения, которых у родителей нет. Для этого использовали секвенирование экзома — участка генома, содержащего инструкции для создания белков. Именно эти регионы несут большинство известных вредных мутаций.

Исследователи обнаружили 35 генов, тесно связанных с аутизмом у латиноамериканцев. Сравнив их с аналогичными данными по европейцам, ученые увидели почти полное совпадение. Нарушения затрагивали одни и те же биологические пути — работу нейронных связей и цитоскелета клетки. То есть механизмы, ведущие к аутизму, везде одинаковы.

Команда также проверила точность инструментов, с помощью которых ученые определяют, насколько ген является «консервативным». Эти методы, созданные на европейских данных, оказались столь же надежными и для латиноамериканской выборки.

Тем не менее в клиниках остаются сложности. Стандартные программы для интерпретации мутаций по‑прежнему чаще определяют их как опасные у европейцев, чем у представителей других групп, потому что базы данных все еще несбалансированы. Кроме того, исследование охватывало только белок-кодирующие регионы ДНК, что затрудняет точное определение происхождения отдельных вариаций.

Чтобы улучшить диагностику, ученые подчеркивают необходимость расширения генетических исследований и включения представителей разных народов. Это позволит уменьшить неравенство в медицине и повысить точность генетического консультирования.